APA zijn gemakkelijk te identificeren op maagcoupes afkomstig van knaagdieren, maar intrinsiek factor antilichamen moeten ook opgespoord worden om de diagnose van pernicieuze anemie te ondersteunen. Patiënten met auto-immuun gastritis hebben enkel anti-lichamen tegen pariëtaal cellen. Deze gastritis wordt gekenmerkt door een lymfo-plsamcellulaire infiltratie van het maagslijmvlies. Een ernstige gastritis kan tot gevolg hebben dat het maagslijmvlies atrofisch wordt, waarbij het maagslijmvlies-epitheel zijn differentiatie in de verschillende celtypen verliest. Om een correcte maagfunctie te evalueren, is het belangrijk te weten of er, onder dergelijke omstandigheden, geen of nog slechts enkele pariëtaal cellen in de maagfundus aanwezig zijn. Deze produceren zowel maagzuur als intrinsiek factor. Intrinsiek factor is nodig voor de passage van vitamine B12 door de darmwand. Patiënten met een vergevorderde auto-immuun gastritis hebben door een verlies van pariëtaalcellen vaak een histamine refractaire achloorhydrie en een vitamine B12-deficiëntie. Dit laatste kan zich dan uiten in onder andere een pernicieuze anemie.