Diarree kan worden veroorzaakt door diverse agentia (bv. bacteriën, virussen, parasieten, chemicaliën) en deze kunnen vergelijkbare symptomen veroorzaken. Een grondige anamnese met symptomen, ernst, duur van de ziekte, leeftijd, reisgeschiedenis, voedselconsumptie, recent antibioticagebruik en familiale ziekten in de familie of andere contacten zal de arts helpen de ziekte te categoriseren en de juiste labotesten aan te vragen. Via kweek kunnen enkel bacteriële enteropathogenen opgespoord worden.