Van volgende virussen kan een resistentiebepaling uitgevoerd worden:
- CMV (humaan cytomegalovirus)
- HSV (herpes simplex virus)
- VZV (varicella-zoster virus
- HHV-6 (humaan herpesvirus 6)
- Andere (contact nemen vooraf)

Mogelijke analysematerialen:
- Volbloed: 3 to 5 ml gecollecteerd in EDTA-tube. Niet invriezen.
- Beenmerg: minimum 1 ml, gecollecteerd in een EDTA-tube. Niet invriezen.
- BAL-vocht: 1 to 3 ml, gecollecteerd in een steriel recipiënt 120 mL met rode schroefdop
- CSF: minimum 1 ml, afname in PP steriele 15 mL-buis met schroefdop
- Pleuravocht: 1 ml, afname in een PP steriele 15 mL-buis met schroefdop
- Biopt: breng over in een steriel potje met witte schroefdop, voeg een beetje steriel fysiologisch water toe om vochtig te houden.
- Monster van de hogere luchtwegen (nasopharyngeaal, nasaal, tracheaal aspiraat, ...): spoel de gewenste locatie met 1 à 2 ml fysiologisch water en verzamel het spoelvocht in een steriel potje met schroefdop
- eSwab: strijk over de gewenste locatie met een steriele, flexibele swab. Breng over in fysiologische oplossing of viraal transportmedium in een steriele tube met schroefstop. Gebruik geen calciumalginaat swab of wisser met houten schacht!
- Urine: 5 to 10 ml gecollecteerd in een urinepot 100 mL (geel deksel).
Breng over in een PP steriele 15 mL-buis met schroefdop.
- Vitreumvocht: afname in een steriel potje met witte schroefdop
- Virale cultuur: cultuur supernatans of geïnfecteerde cellen

Bij CMV genotypering wordt eerst een preliminaire screening uitgevoerd om mutaties in het UL97 gen, die resistentie tegen ganciclovir verlenen, te detecteren (een voorlopig rapport na enkele dagen laat toe de antivirale behandeling eventueel aan te passen). Vervolgens worden de volledige UL97 en UL54 genen gesequenced (Finaal rapport). Fenotypering wordt enkel uitgevoerd als het virus aan relatief hoge titers groeit in vitro.