De HCV genotypering op basis van NS5B ONT sequencing is een in huis ontwikkelde kwalitatieve test uitgevoerd op het ONT MinIon platform. Na RNA extractie en opzuivering op de Qiasymphony, wordt het NS5B gen geamplificeerd en gesequeneerd. Via de Epi2Me alignment workflow wordt het gesequeneerd amplicon vergeleken met alle bestaande genotypes in een databnk die leidt tot een correct identificatie van alle genotypes en subtypes van 1 tot 6